
Second Brain Mcp
io.github.PortaltocodingPublished by GitHub account Portaltocodingv0.1.1Updated Oct 24, 2026
Second brain en Obsidian: notas, conceptos como nodos, resurfacing y salud del grafo. En castellano.
The publisher's own server: BrainDog
Overview
A local MCP server that turns a folder of Markdown notes into an Obsidian-based second brain, letting an assistant capture notes, link ideas and resurface them.
- What you can do
- Capture readings, notes and ideas: create reading sheets, save notes while reading, promote ideas to permanent notes and link two ideas with a written reason, plus a per-project scratch area with listing and promotion of notes into the library. Resurface and search: given a task or question, return the most connected notes, or run a bounded full-text search across the vault. Prune the graph: report orphan notes, broken links, undefined or duplicate concepts, and merge split concept nodes. Read whole notes as MCP resources by reading, note or concept title. Guide onboarding and ingestion through built-in prompts that classify text and propose ideas before creating anything.
- When to use it
- Useful if you keep notes as plain Markdown in an Obsidian vault and want an assistant to file what you read, turn it into linked ideas and bring related notes back when you work on something. Also suited to keeping a small per-project scratch folder that can later be promoted into the main library.
- Requirements
- Runs locally over stdio as an npm package, so Node.js 18 or newer is needed (or the double-click bundle for Claude Desktop). The BRAIN_VAULT environment variable points at the Markdown vault folder; if unset, a default folder under the home directory is used. Optional BRAIN_MODO selects the lexico or rag engine. No account, API key or network access is required.
Installation
In SourceWeft
- Open Second Brain Mcp in the dashboard and add it to a workspace.
- Enable the server for the chats that should use its tools.
Desktop only via STDIO. STDIO servers start a local process, so they need the SourceWeft desktop host.
Other MCP clients
Follow the launch instructions in the repository.
README
second-brain-mcp
Español · English
[npm] [tests] [node] [license]
Tu segundo cerebro, en tu Obsidian, hablando con tu asistente.
Esto es un servidor MCP que convierte una carpeta de Markdown en un second brain de verdad: capturas lo que lees, lo conviertes en ideas con tus palabras, y esas ideas se conectan entre sí hasta formar un grafo que piensa contigo: cuando trabajas en algo, las notas relacionadas aparecen solas.
Todo en castellano. Todo en ficheros tuyos. Sin bases de datos, sin nube, sin magia que no puedas abrir con un editor de texto.
¿Cómo se siente?
Le dices a tu asistente:
«Estoy leyendo Hábitos Atómicos, apunta esto: el entorno decide más que la fuerza de voluntad»
y él crea la lectura si no existía, guarda el apunte, y cuando esa idea madure la
convierte en una nota permanente conectada al concepto [[Hábitos]], que a su
vez acumula todo lo que has pensado sobre el tema, venga del libro que venga.
Semanas después, trabajando en otra cosa, preguntas por diseñar tu rutina de mañanas y el sistema te trae de vuelta «El entorno decide por ti» con el párrafo exacto. Eso es el segundo cerebro: no recordar tú, que recuerde él.
El mapa
Cada etiqueta es método / qué es; en las dos puertas principales va también la
frase que lo dispara:
Instalación
Lo más rápido: una línea, sin configurar nada
Si usas Claude Code:
Con cualquier otro cliente MCP:
Sin variables de entorno y sin decidir nada: tu cerebro se monta en
~/second-brain, con las tres carpetas y la portada listas. Dile a tu asistente
«hazme el onboarding de mi second brain» y ya estás dentro.
¿Prefieres que viva en tu vault de Obsidian de siempre? Añade
BRAIN_VAULT=/ruta/a/tu/vault y punto — el servidor solo escribe en tres
subcarpetas y no toca nada más. Y si ya empezaste en el vault por defecto,
mueve la carpeta a donde quieras y apunta BRAIN_VAULT allí: son ficheros
Markdown, no hay nada que migrar.
Sin terminal: doble clic y listo
Si usas Claude Desktop y no quieres saber nada de comandos ni de JSON,
descarga
second-brain.mcpb
y haz doble clic: Claude Desktop lo abre, te pide elegir la carpeta donde
vivirá tu cerebro (tu vault de Obsidian si tienes, o una carpeta vacía
cualquiera) y ya está. No necesitas instalar Node ni tocar ningún fichero de
configuración. Y si además quieres ver tu cerebro dibujado como un grafo,
instala Obsidian y abre esa misma carpeta como vault.
Con terminal, eligiendo tú la carpeta
Necesitas Node 18 o más nuevo. Con Claude Code, a nivel de usuario (disponible en todos tus proyectos):
Con cualquier otro cliente MCP:
Y listo. La primera nota crea las carpetas que hagan falta.
Una salvaguarda: si la ruta que configuras no existe y su carpeta contenedora tampoco, el servidor da por hecho que es un error al escribirla y te lo dice en la conversación en vez de plantarte un vault en una carpeta fantasma. Si el padre existe, la crea sin preguntar: eso es lo que querías.
Si prefieres dejar el vault montado desde el principio (carpetas + portada), hay andamiaje:
Es idempotente: sobre un vault que ya existe no toca nada.
Variables de entorno
Tu primera sesión
No te la tienes que inventar: dile a tu asistente «hazme el onboarding de mi
second brain» (es el prompt empezar; en Claude Code aparece como el comando
/mcp__second-brain__empezar) y él te guía paso a paso: mira cómo está tu
vault, planta contigo la primera lectura y la primera idea con tus propias
palabras, te enseña qué devuelve resurgir con tu material, y te deja la
chuleta de los tres gestos del día a día. Si el vault ya tiene contenido no te
trata de nuevo: te hace un tour de lo que hay.
Pruébalo en 30 segundos
El repo trae un vault de ejemplo ya tejido en ejemplo/, con dos lecturas,
cuatro ideas y cuatro conceptos conectados entre sí, así que puedes ver el
grafo funcionando antes de haber escrito una sola nota tuya:
Y le preguntas a tu asistente algo como «¿qué sé yo sobre la fuerza de
voluntad?». También puedes abrir la carpeta ejemplo/ como vault en Obsidian
y ver el grafo dibujado.
Una sesión de verdad
Así se ve el día a día, sin aprenderse ninguna tool:
Tú: añade esto a mi second brain, lo más importante: "llevo semanas notando que si dejo el móvil en otra habitación por la mañana me salen dos horas de trabajo del tirón, y si lo tengo al lado voy a rachas de diez minutos entre miradas"
Asistente: esto es un pensamiento tuyo ya digerido, así que va como nota permanente en modo destilar. La idea fuerte que veo: «La distancia física al móvil marca la profundidad del trabajo», con los conceptos
FocoyEntorno, que ya existen en tu grafo. ¿La creo así?Tú: dale
Asistente: creada. Y resuena fuerte con «El foco se diseña, no se invoca» (score 8): las dos hablan de preparar el entorno en vez de confiar en la voluntad. ¿Las enlazo con ese motivo?
Tú: sí
Asistente: enlazadas, motivo escrito en las dos. Te dejo el enlace para abrirla en Obsidian:
obsidian://open?path=...
Fíjate en el orden: el asistente propone, tú decides, y cada conexión queda con su porqué escrito. Eso es todo el sistema.
Las tres carpetas
La regla de oro: nada entra suelto. Cada idea se enlaza a su origen, a los conceptos que toca y, con moderación, a otras ideas. Y la moderación importa: máximo 2-3 notas relacionadas, cada enlace con su porqué escrito. Un cajón con doce enlaces no conecta nada; tres enlaces con motivo son un mapa.
Qué sabe hacer
Capturar. lectura_crear abre la ficha de un libro o artículo;
lectura_nota guarda apuntes mientras lees («cap 3: ...»); cuando una idea es
tuya de verdad, nota_permanente la sube a 50-Notas/ con sus temas convertidos
en conceptos navegables. nota_enlazar une dos ideas y deja escrito por qué.
Pensar. resurgir es el corazón: le das un texto (una tarea, una duda, una
idea a medias) y te devuelve las notas más conectadas con él. Solo aparece cuando
hay solape real; si no hay nada, no inventa. vault_buscar es el grep de toda la
vida, acotado para no inundar (20 resultados y te avisa si hubo más).
Podar. Los grafos se pudren en silencio. jardin te enseña las notas
huérfanas, los enlaces rotos, los conceptos que nadie definió, las notas
sobreconectadas y los conceptos duplicados («Hábito» y «Habitos» partiendo los
backlinks en dos). concepto_fusionar cose los nodos partidos.
Taller por proyecto. Cualquier repo puede tener su brain/ local con
apuntes crudos (mini_nota). mini_listar te dice cuáles se han ganado subir a
la biblioteca (resuenan fuerte con lo que ya tienes, o llevan una semana
madurando) y mini_promover los sube. Taller abajo, biblioteca arriba: y
promover siempre es decisión tuya.
La ingesta: un solo gesto
No hace falta que te aprendas las tools. Dile a tu asistente:
«añade esto directo a mi second brain» «añade lo más importante de esto» «apunta esto que estoy escribiendo»
y la ingesta se dispara según toque. El servidor trae el procedimiento escrito
(prompt MCP ingerir; en Claude Code aparece como comando
/mcp__second-brain__ingerir): clasifica el texto (¿lectura con fuente, idea
tuya, apunte de taller?), aplica el modo (directo guarda íntegro, destilar
extrae las 1-3 ideas fuertes en tus palabras y te las enseña antes de crear
nada, auto decide y te lo dice), identifica 2-4 conceptos (prefiriendo los
que ya existen en tu grafo antes que inventar sinónimos), y teje. Las decisiones
son tuyas y están marcadas como tales: qué ideas entran y qué conexiones se
crean. Vale para un párrafo pegado, un capítulo, o ese documento de Word que
estás escribiendo: pégalo o pásale el fichero.
Leer notas: resources
Cada nota del grafo es también un resource MCP, así que leerla entera no
gasta una tool call (y en Claude Code puedes adjuntarla con @):
El patrón que funciona: buscar barato (vault_buscar, resurgir), leer entero
solo lo que interesa (el resource).
¿Y si no uso Claude?
Funciona igual, porque esto es MCP estándar y el protocolo ya lo habla casi todo el mundo. La escalera completa, de más cómodo a más independiente:
- Claude Desktop: la vía del doble clic con el
.mcpb. La única sin tocar nada. - Cualquier otro cliente MCP (ChatGPT de escritorio, Cursor, VS Code, Windsurf, Zed, Gemini CLI...): usa el bloque de configuración JSON de arriba, que es el mismo para todos.
- Sin cuenta de nada y sin internet: LM Studio soporta MCP con modelos locales, así que tu second brain puede hablar con un modelo que corre en tu propio ordenador y tus notas no salen de tu disco jamás.
- Sin ninguna IA: el vault son ficheros Markdown normales con wikilinks normales. Con Obsidian a secas ya tienes un second brain manual perfectamente usable; el servidor es el copiloto que captura, destila y te trae las ideas de vuelta, pero tus notas nunca son rehenes de nadie.
Cómo se lleva con Obsidian
Es su casa. Todo es Markdown plano con wikilinks nativos: graph view, backlinks
y hover preview funcionan sin plugins. El servidor relee siempre (nunca cachea)
y escribe de forma atómica, así que puedes editar en Obsidian con el servidor
corriendo sin que se pisen. El jardin juzga los enlaces como Obsidian: sin
distinguir mayúsculas.
Dos detalles útiles:
- Cada nota creada devuelve su
rutaen disco —que sirve siempre— y un enlaceabrir(obsidian://open?path=...): un clic y estás en la nota dentro de la app, si la tienes. Va por ruta absoluta, así que da igual cómo hayas llamado a tu vault o que apuntes a una subcarpeta suya. temasyrelacionadasviven en las propiedades (frontmatter). Obsidian los trata como enlaces reales, pero para verlos en el graph view activa «Propiedades» en los ajustes del grafo.
¿Y Notion? No. Este servidor trabaja sobre ficheros Markdown locales. Esa es la gracia: tus datos son tuyos, se abren con cualquier editor y el grafo va a la velocidad del disco, no de una API. Obsidian tampoco es obligatorio (vale cualquier carpeta
.md); es solo el mejor visor. Si vienes de Notion: exporta tus notas como Markdown y suéltalas en el vault, y eso sí funciona.
Modo lexico y modo rag
resurgir tiene dos motores, y el sistema te dice cuándo cambiar:
lexico(por defecto): puntúa coincidencias donde más significan: título ×3, temas ×2, cuerpo ×1. Directo y transparente; con un brain pequeño o mediano es todo lo que necesitas.rag: BM25 por fragmentos con stemming castellano: «hábito» encuentra «hábitos», y en vez de decirte solo qué nota conecta, te devuelve el párrafo exacto que responde, listo para usar como contexto. Pensado para cuando el brain crece y las notas son largas.
¿Cuál usar? No lo pienses: empieza en lexico y deja que el sistema te guíe.
La sugerencia de pasar a rag aparece solo cuando toca, cuando se dan las
dos cosas a la vez:
- tu brain ya es un puñado grande de notas (50+, configurable con
BRAIN_RAG_UMBRAL), y - la búsqueda que acabas de hacer volvió floja en léxico (sin resultados o por debajo del listón de conexión fuerte); es decir, justo el momento en que el rag habría ayudado.
Y una sola vez por sesión: te lo dice, te explica el porqué, y no vuelve a
insistir. Si el léxico encuentra fuerte, no te interrumpe nadie. Probar es
gratis: repite la consulta con modo: "rag" y compara; si convence, se fija
con BRAIN_MODO=rag. Sin índices que reconstruir ni modelos que descargar:
los dos motores releen el vault al vuelo, así que puedes seguir editando en
Obsidian sin miedo.
Los principios (por si te preguntas por qué es así)
- La escasez es el significado. Las sugerencias de conexión solo aparecen cuando son fuertes (y como mucho dos). Enlazarlo todo con todo es lo mismo que no enlazar nada.
- Enlazar es decisión tuya. El sistema sugiere; tú decides. Ninguna conexión se crea como efecto secundario.
- El vault manda. El servidor relee siempre y no cachea: edita a mano, usa Obsidian, sincroniza con lo que quieras. Escritura atómica y frontmatter editado línea a línea: tu formato no se toca.
- El contexto se paga. Respuestas en JSON compacto, búsquedas acotadas,
diagnósticos con techo. Las tools de solo lectura van marcadas (
readOnlyHint) y la única destructiva (concepto_fusionar) también, para que tu cliente pida confirmación donde toca.
Desarrollo
Licencia
MIT. Úsalo, cámbialo, hazlo tuyo.
Source: README.md at commit 82f6c81
Tools
0Version history
1- v0.1.1LatestSep 16, 2026
Score
50% of the applicable checks met
How complete this listing is, computed from the registry entry, the endpoint and public sources. Not a rating of the server and not a statement that it is safe or working today: reachability is a dated check, and no installs or reviews go into the score.
- Reached in the last 30 days25 pts
Keep the endpoint answering the MCP handshake; SourceWeft probes it every 30 days.
- Auth declared10 pts
Declare the credential headers in the registry entry, or keep the endpoint answering the probe so its auth can be classified.
- Tools listed15 pts
Answer tools/list without a credential, or ship a package that starts in a sandbox without one.
- DescriptionRequired15 pts
- Logo10 pts
- Documentation15 pts
- License10 pts
Other Brain integrations

BrainDog
dog.brainOfficial publisher
BrainDog is a hosted record of projects, decisions and money that connected AI agents read before starting work and write their results into.

Codebase Brain
Published by GitHub account Nomannazir
Indexes a local or public git codebase so an assistant can search it, trace git history, check change impact and find stale docs, all with path:line citations.

Personal Brain
Published by GitHub account zhang-liz
Gives an AI assistant memory of your professional network, stored as a graph in FalkorDB, so it can look up contacts, find people by topic, and save who you…

Second Brain
Published by GitHub account ara-5
Shared Graph-RAG memory for AI agents: markdown vault, wikilink recall, tasks, messaging.

Make0 Brain
Published by GitHub account make0-official
Local, offline memory server that gives Claude Code, Cursor, Codex and other MCP agents one shared, versioned store of durable facts.