Tomesphere

com.tomesphere由 tomesphere.com 发布官方发布者v0.1.0更新于 Oct 24, 2026

Search 8.5M scientific papers with LLM TLDRs, citations, linked entities, figures, and full text.

已验证Streamable HTTP可网页运行知识与记忆AI 与机器学习

概览

AI 生成的概览

Tomesphere 是一个远程 MCP 服务器,让助手检索 850 万篇学术论文,并获取其元数据、引用关系、全文、图表和关联的生物医学实体。

可以做什么
按主题、关键词、作者或关联的基因、蛋白质、疾病实体检索论文,每条结果含标题、TLDR 和链接。获取论文完整元数据,包括作者、摘要、TLDR、关键发现、引用次数、代码与模型链接及同行评审。浏览引用网络:引用该论文的文献、该论文引用的文献,以及语义相似的论文。以 Markdown 形式获取论文正文全文,用于摘要无法回答的问题。获取带标签和说明的图表图像,以及基因、疾病、突变、临床试验编号等生物医学实体。将基因或蛋白质名称解析为 UniProt 编号和三维结构模型。
适用场景
适合文献综述、查找相关工作或后续研究,以及需要论文方法或结果而非摘要的深入问题。也适合将论文与基因、疾病和蛋白质结构关联起来的生物医学研究。
运行要求
通过 streamable HTTP 访问的远程 MCP 端点;未声明软件包、环境变量或请求头。需要能访问该端点的网络。
安装前请注意
说明指出 2024 年及以后的引用覆盖较稀疏,索引仍在进行,近期影响力可能被低估。图表覆盖不均:多数生物医学论文有图,arXiv 论文常常没有。未声明身份验证,请勿发送机密材料。

安装

在 SourceWeft 中

  1. 打开 控制台中的 Tomesphere,将其添加到工作区。
  2. 为需要使用其工具的对话启用该服务。

Web executable,通过 Streamable HTTP。 远程服务在工作区中配置后即可从网页运行时运行。

交给智能体安装

把这段提示词粘贴到 Claude Code、Codex、Cursor 等智能体,或 SourceWeft 对话中。智能体会读取该服务器的安装指南,先向你展示发布者、端点和登录方式,经你同意后再把它添加到你的客户端。密钥不会写进任何命令。

阅读 https://sourceweft.com/mcp/com.tomesphere%2Ftomesphere/install.md,并按其中说明把这个 MCP 服务器接入我的客户端。修改任何配置之前,先告诉我它的发布者、端点和登录方式,等我确认。不要把 API 密钥写进命令或我会提交的文件;问我密钥应从哪里获取。

查看智能体所依据的安装指南

其他 MCP 客户端

把它添加到你客户端的 mcpServers 配置中。

{
  "mcpServers": {
    "tomesphere": {
      "type": "http",
      "url": "https://mcp.tomesphere.com/api/mcp"
    }
  }
}

工具

9

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Search papers

Search 8.5 million academic papers (arXiv + biomedical: PMC / bioRxiv / medRxiv, all disciplines) by topic, keyword, author, or linked entity (gene / protein / disease). Each hit returns id, title, TLDR, type, and links. Use to find papers about a topic, e.g. 'transformer efficiency' or 'CRISPR base editing'.

输入参数kquery必填year_maxyear_min

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Get paper

Fetch a paper's full metadata: title, authors, year, abstract, TLDR (LLM-generated), key findings, citation count, GitHub repos, HuggingFace models/datasets, videos, peer reviews, and links. Accepts an arXiv ID (e.g. '2401.12345' or '1706.03762v5') or an OpenAlex Work ID (e.g. 'W4390723197'). Use when the user names a specific paper or pastes an arXiv link.

输入参数id必填

similar_papers

Similar papers

Find papers semantically similar to a given paper using SPECTER2 embeddings (trained on scientific-citation triplets). Returns nearest neighbors with TLDR. Use when the user wants 'papers like X' or 'what's adjacent to this work'.

输入参数kid必填

citations

Citing papers

Get papers that cite the given paper (who refers to this work). Use when the user asks 'who cites X', 'what's the impact', or wants follow-up work. Note: 2024+ citation coverage is sparse; indexing in progress.

输入参数kid必填

references

References

Get the papers that this paper cites (its bibliography). Use when the user asks 'what does X cite' or 'show me the references'.

输入参数kid必填

get_full_text

Get full text

Fetch a paper's full body text as Markdown (methods, results, protocols, inline tables) — use for deep questions the abstract can't answer. Accepts an arXiv ID (2401.12345), a PMC ID (PMC5339222), or a bioRxiv/medRxiv DOI (10.1101/…).

输入参数id必填

get_figures

Get figures

Get a paper's real figure images — URLs, labels, and captions. Most biomedical papers have figures; arXiv papers often don't. Accepts an arXiv ID, PMC ID, or bioRxiv/medRxiv DOI.

输入参数id必填

get_entities

Get linked entities

Get the biomedical entities linked to a paper: genes, proteins, chemicals, diseases, species, mutations, cell lines, and clinical-trial (NCT) IDs. Accepts an arXiv ID, PMC ID, or bioRxiv/medRxiv DOI.

输入参数id必填

get_structure

Get 3D structure

Resolve a gene/protein name (e.g. 'TP53', 'CD44') or UniProt accession to its 3D structure — returns the UniProt accession + AlphaFold model URL (and PDB when available). Great for a gene named in a paper's entities.

输入参数name必填

版本历史

1
  1. v0.1.0最新Sep 16, 2026

评分

已满足适用检查项的 83%

该评分衡量此收录条目的完整程度,依据注册中心条目、端点与公开来源计算得出。它不是对服务器本身的评价,也不表示服务器安全或当前可用:可连通性是带日期的检查结果,评分也不包含安装量或用户评价。

  • 近 30 天内可连通必需25 分
  • 已声明认证方式必需10 分
  • 已列出工具必需15 分
  • 描述必需15 分
  • 图标10 分
  • 文档15 分

    请声明包含 README 的 GitHub 仓库,或在 OAuth 受保护资源元数据中提供 resource_documentation。

  • 许可证不适用

    托管服务按其提供方的条款使用,因此这里不要求许可证。此检查项不计入百分比。