Raras

io.github.rarasAI由 GitHub 账号 rarasAI 发布v0.2.0更新于 Oct 25, 2026

Disease Twin — Brazil's rare-disease knowledge graph (10,468) over MCP. Source-grounded, PT-BR.

已验证Streamable HTTP可网页运行知识与记忆数据与分析AI 与机器学习

概览

AI 生成的概览

一个远程只读 MCP 服务器，基于巴西罕见病知识图谱，让助手检索疾病、表型、SUS 覆盖、临床试验和 PubMed 文献，并做有出处的图谱推理。

可以做什么
检索与读取疾病记录：全文检索并可按 SUS 或试验筛选，查看含 HPO 表型、基因和临床描述的疾病详情，以及按嵌入或共享 HPO 表型查找相似疾病。将症状映射为葡萄牙语或英语的 HPO 术语，排除被否定的表述，并按表型 ID 匹配疾病以辅助鉴别诊断。查询巴西公共卫生信息：SUS 覆盖（CEAF、SIGTAP、PNTN）和按疾病与州查找参考中心。探索生物医学文献：对 PubMed 论文做语义检索，并查找与某疾病相关的文献。在图谱上推理：查看模式、多跳证据路径、带类型的文献关系、药物重定位假设、研究日志和近期更新。
适用场景
适合在巴西语境下处理罕见病：把症状映射为 HPO 术语、生成鉴别诊断候选、查询 SUS 覆盖或参考中心，或查找文献与研究假设。也适合以有出处、可引用的证据探索生物医学知识图谱。
运行要求
远程 Streamable HTTP 端点；未声明需要安装、账户或 API 密钥。需要能访问该端点的网络。服务器要求调用方将表型查询控制在每分钟少量调用，并在收到限流响应时退避。
安装前请注意
只读且公开，但涉及健康相关内容：临床病例分析和药物重定位假设明确仅为信息参考，绝非诊断或临床建议。表型查询仅覆盖葡萄牙语和英语。存在速率限制，频繁轮询近期更新可能被限流。依赖前应对照所引来源核实证据。

安装

在 SourceWeft 中

  1. 打开 控制台中的 Raras，将其添加到工作区。
  2. 为需要使用其工具的对话启用该服务。

Web executable，通过 Streamable HTTP。 远程服务在工作区中配置后即可从网页运行时运行。

交给智能体安装

把这段提示词粘贴到 Claude Code、Codex、Cursor 等智能体，或 SourceWeft 对话中。智能体会读取该服务器的安装指南，先向你展示发布者、端点和登录方式，经你同意后再把它添加到你的客户端。密钥不会写进任何命令。

阅读 https://sourceweft.com/mcp/io.github.rarasAI%2Fraras/install.md，并按其中说明把这个 MCP 服务器接入我的客户端。修改任何配置之前，先告诉我它的发布者、端点和登录方式，等我确认。不要把 API 密钥写进命令或我会提交的文件；问我密钥应从哪里获取。

查看智能体所依据的安装指南

其他 MCP 客户端

把它添加到你客户端的 mcpServers 配置中。

{
  "mcpServers": {
    "raras": {
      "type": "http",
      "url": "https://raras.org/api/mcp"
    }
  }
}

README

Raras Disease Twin — MCP Server

Brazilian rare-disease knowledge graph (10,468 diseases) exposed via the Model Context Protocol (MCP). Each disease is an addressable Disease Twin (disease://{orphaCode}): genes, HPO phenotypes, SUS coverage, clinical trials, literature-mined treatments, repurposing hypotheses, and grounded multi-hop reasoning — PT-BR first, source-grounded, never diagnoses.

Connect (no install)

  • Remote endpoint: https://raras.org/api/mcp (Streamable HTTP, public, read-only)
  • Claude Code: claude mcp add --transport http raras https://raras.org/api/mcp
  • claude.ai / Desktop: Settings → Connectors → Add custom connector → paste the URL
  • Docs: https://raras.org/mcp

Skill

SKILL.md is an installable Claude Skill — drop it in .claude/skills/raras-disease-twin/.

License

Data: CC-BY-4.0 · Code: MIT · https://raras.org

来源：README.md，提交 f36a0d8

工具

20

search_diseases

Buscar doenças raras

Full-text search em 10.468 doenças raras. Suporta filtros SUS/trials.

输入参数limitquery必填filter_has_sus_coveragefilter_has_active_trials

get_disease_detail

Detalhes de doença rara

Fenótipos HPO, genes, SUS, trials, descrição clínica em PT.

输入参数orphaCode必填

find_diseases_by_phenotypes

Buscar doenças por fenótipos

Match por IDs HPO. Use para diagnóstico diferencial.

输入参数limithpo_ids必填

search_phenotypes

Buscar fenótipos HPO

Lookup HPO em PT-BR (encoder Araras-HPO-Brasil + léxico leigo) ou EN (vocabulário HPO). Retorna IDs HP: com estado de asserção: termo NEGADO ("nunca desmaiei") NÃO vira fenótipo. Outros idiomas não são cobertos. Limite de taxa: use poucas chamadas por minuto (429 = espere).

输入参数limitquery必填

get_sus_coverage

Cobertura SUS

CEAF, SIGTAP, PNTN, nível de integração.

输入参数orphaCode必填

find_reference_centers

Centros de referência

Centros por doença e/ou UF, com CNES.

输入参数limitstateorphaCode

find_active_trials

Ensaios clínicos ativos

Trials ativos com filtro Brazil.

输入参数limitorphaCode必填in_brazil_only

find_similar_diseases

Doenças similares

Vector similarity via embeddings SOTA.

输入参数limitorphaCode必填

find_phenotypically_similar

Doenças com fenótipos similares

Doenças com perfil de fenótipos HPO semelhante (simGIC pré-computado, explicável: nº de fenótipos em comum). Complementa find_similar_diseases (semântico).

输入参数limitorphaCode必填

get_graph_stats

Estatísticas do grafo

Contagens e métricas do dataset.

无需输入参数。

search_papers_semantic

Busca semântica de papers

Busca vetorial sobre 424k papers do PubMed. Use caso clínico, pergunta ou conjunto de sintomas.

输入参数limitquery必填min_score

find_papers_for_disease

Papers de uma doença

Literatura relacionada a uma doença via embeddings (:SEMANTIC_MATCH, fallback vetorial).

输入参数limitmin_scoreorphaCode必填

analyze_clinical_case

Analisar caso clínico

Caso clínico → doenças candidatas + literatura relevante em 1 chamada. Apenas informativo, nunca diagnóstico.

输入参数papers_limitdiseases_limitcase_description必填

get_schema

Esquema do grafo

Node labels, relationship types e property keys do grafo. Use antes de cypher_query.

无需输入参数。

explain_relation

Explicar relação (MedGraphRAG, raciocínio multi-hop)

Raciocínio fundamentado sobre o grafo: dada uma pergunta (ex.: "por que o gene X se associa à doença Y?", "como a droga Z se relaciona a esta doença?"), retorna caminhos de evidência multi-hop (doença↔gene↔via↔droga↔fenótipo) com proveniência citável. Se não houver caminho no grafo, recusa — nunca inventa.

输入参数query必填hpo_idsmax_hops

get_literature_relations

Relações mineradas da literatura (PubTator3)

Relações tipadas extraídas da literatura biomédica (associate/treat/cause/inhibit/stimulate/prevent) entre a doença e genes/fármacos, com nº de publicações como proveniência. Filtrável por predicado.

输入参数orphaCode必填predicate

get_hypotheses

Hipóteses de reposicionamento (co-scientist)

Candidatos a reposicionamento de fármacos gerados por associação de genes (guilt-by-association): drogas que tratam outras doenças que compartilham genes com esta. HIPÓTESES para investigação, NUNCA recomendações clínicas — cada uma rastreável (via gene X, da doença Y).

输入参数orphaCode必填

get_research_log

Diário de pesquisa do Disease Twin

Registro cronológico do que o agente autônomo fez por esta doença: autoria, mineração de literatura, evidência genética, verificação, prospecção de fontes, recomputação de relações. Prova de que o gêmeo digital estuda a doença continuamente.

输入参数orphaCode必填

get_recent_updates

Disease Twins atualizados recentemente

Doenças cujo gêmeo digital ganhou evidência nova (autoria, PubTator3, Open Targets, verificação) nos últimos N dias. Faça polling para acompanhar mudanças (substituto stateless de subscriptions).

输入参数dayslimit

get_evidence

Proveniência / evidências

Cross-references de autoridade (Orphanet, MONDO, OMIM, MeSH, GARD, UMLS), status de verificação e PMIDs de uma doença. A base da regra "nunca inventar".

输入参数orphaCode必填

版本历史

1
  1. v0.2.0最新Sep 16, 2026

评分

已满足适用检查项的 90%

该评分衡量此收录条目的完整程度，依据注册中心条目、端点与公开来源计算得出。它不是对服务器本身的评价，也不表示服务器安全或当前可用：可连通性是带日期的检查结果，评分也不包含安装量或用户评价。

  • 近 30 天内可连通必需25 分
  • 已声明认证方式必需10 分
  • 已列出工具必需15 分
  • 描述必需15 分
  • 图标10 分
  • 文档15 分
  • 许可证10 分

    请在仓库或注册中心条目中声明许可证。