Raras

io.github.rarasAI由 GitHub 帳號 rarasAI 發布v0.2.0更新於 Oct 25, 2026

Disease Twin — Brazil's rare-disease knowledge graph (10,468) over MCP. Source-grounded, PT-BR.

已驗證Streamable HTTP可網頁執行知識與記憶資料與分析AI 與機器學習

概覽

AI 產生的概覽

遠端唯讀的 MCP 伺服器，建構於巴西罕見疾病知識圖譜，讓助理檢索疾病、表型、SUS 給付、臨床試驗與 PubMed 文獻，並進行有出處的圖譜推理。

可以做什麼
檢索與讀取疾病資料：全文檢索並可依 SUS 或試驗篩選，查看含 HPO 表型、基因與臨床描述的疾病詳情，以及依嵌入或共用 HPO 表型尋找相似疾病。將症狀對應為葡萄牙語或英語的 HPO 術語，排除被否定的描述，並依表型 ID 比對疾病以協助鑑別診斷。查詢巴西公共衛生資訊：SUS 給付（CEAF、SIGTAP、PNTN）以及依疾病與州別尋找參考中心。探索生物醫學文獻：對 PubMed 論文做語意檢索，並找出與某疾病相關的文獻。在圖譜上推理：檢視結構、多跳證據路徑、具型別的文獻關係、藥物再定位假設、研究日誌與近期更新。
適用情境
適合在巴西情境下處理罕見疾病：把症狀對應為 HPO 術語、產生鑑別診斷候選、查詢 SUS 給付或參考中心，或尋找文獻與研究假設。也適合以有出處、可引用的證據探索生物醫學知識圖譜。
執行需求
遠端 Streamable HTTP 端點；未宣告需要安裝、帳號或 API 金鑰。需要能連線至該端點的網路。伺服器要求呼叫端將表型查詢控制在每分鐘少量呼叫，並在收到限流回應時退避。
安裝前請注意
唯讀且公開，但涉及健康相關內容：臨床病例分析與藥物再定位假設明確僅供參考，絕非診斷或臨床建議。表型查詢僅涵蓋葡萄牙語與英語。設有速率限制，頻繁輪詢近期更新可能被限流。依賴前應對照所引來源核實證據。

安裝

在 SourceWeft 中

  1. 開啟 儀表板中的 Raras，將其新增到工作區。
  2. 為需要使用其工具的對話啟用該服務。

Web executable，透過 Streamable HTTP。 遠端服務在工作區中設定後即可從網頁執行環境執行。

交給代理程式安裝

把這段提示詞貼上到 Claude Code、Codex、Cursor 等代理程式，或 SourceWeft 對話中。代理程式會讀取該伺服器的安裝指南，先向你展示發布者、端點和登入方式，經你同意後再把它新增到你的客戶端。金鑰不會寫進任何命令。

閱讀 https://sourceweft.com/mcp/io.github.rarasAI%2Fraras/install.md，並按其中說明把這個 MCP 伺服器接入我的客戶端。修改任何設定之前，先告訴我它的發布者、端點和登入方式，等我確認。不要把 API 金鑰寫進命令或我會提交的檔案；問我金鑰應從哪裡取得。

檢視代理程式所依據的安裝指南

其他 MCP 客戶端

把它新增到你客戶端的 mcpServers 設定中。

{
  "mcpServers": {
    "raras": {
      "type": "http",
      "url": "https://raras.org/api/mcp"
    }
  }
}

README

Raras Disease Twin — MCP Server

Brazilian rare-disease knowledge graph (10,468 diseases) exposed via the Model Context Protocol (MCP). Each disease is an addressable Disease Twin (disease://{orphaCode}): genes, HPO phenotypes, SUS coverage, clinical trials, literature-mined treatments, repurposing hypotheses, and grounded multi-hop reasoning — PT-BR first, source-grounded, never diagnoses.

Connect (no install)

  • Remote endpoint: https://raras.org/api/mcp (Streamable HTTP, public, read-only)
  • Claude Code: claude mcp add --transport http raras https://raras.org/api/mcp
  • claude.ai / Desktop: Settings → Connectors → Add custom connector → paste the URL
  • Docs: https://raras.org/mcp

Skill

SKILL.md is an installable Claude Skill — drop it in .claude/skills/raras-disease-twin/.

License

Data: CC-BY-4.0 · Code: MIT · https://raras.org

來源：README.md，提交 f36a0d8

工具

20

search_diseases

Buscar doenças raras

Full-text search em 10.468 doenças raras. Suporta filtros SUS/trials.

輸入參數limitquery必填filter_has_sus_coveragefilter_has_active_trials

get_disease_detail

Detalhes de doença rara

Fenótipos HPO, genes, SUS, trials, descrição clínica em PT.

輸入參數orphaCode必填

find_diseases_by_phenotypes

Buscar doenças por fenótipos

Match por IDs HPO. Use para diagnóstico diferencial.

輸入參數limithpo_ids必填

search_phenotypes

Buscar fenótipos HPO

Lookup HPO em PT-BR (encoder Araras-HPO-Brasil + léxico leigo) ou EN (vocabulário HPO). Retorna IDs HP: com estado de asserção: termo NEGADO ("nunca desmaiei") NÃO vira fenótipo. Outros idiomas não são cobertos. Limite de taxa: use poucas chamadas por minuto (429 = espere).

輸入參數limitquery必填

get_sus_coverage

Cobertura SUS

CEAF, SIGTAP, PNTN, nível de integração.

輸入參數orphaCode必填

find_reference_centers

Centros de referência

Centros por doença e/ou UF, com CNES.

輸入參數limitstateorphaCode

find_active_trials

Ensaios clínicos ativos

Trials ativos com filtro Brazil.

輸入參數limitorphaCode必填in_brazil_only

find_similar_diseases

Doenças similares

Vector similarity via embeddings SOTA.

輸入參數limitorphaCode必填

find_phenotypically_similar

Doenças com fenótipos similares

Doenças com perfil de fenótipos HPO semelhante (simGIC pré-computado, explicável: nº de fenótipos em comum). Complementa find_similar_diseases (semântico).

輸入參數limitorphaCode必填

get_graph_stats

Estatísticas do grafo

Contagens e métricas do dataset.

無需輸入參數。

search_papers_semantic

Busca semântica de papers

Busca vetorial sobre 424k papers do PubMed. Use caso clínico, pergunta ou conjunto de sintomas.

輸入參數limitquery必填min_score

find_papers_for_disease

Papers de uma doença

Literatura relacionada a uma doença via embeddings (:SEMANTIC_MATCH, fallback vetorial).

輸入參數limitmin_scoreorphaCode必填

analyze_clinical_case

Analisar caso clínico

Caso clínico → doenças candidatas + literatura relevante em 1 chamada. Apenas informativo, nunca diagnóstico.

輸入參數papers_limitdiseases_limitcase_description必填

get_schema

Esquema do grafo

Node labels, relationship types e property keys do grafo. Use antes de cypher_query.

無需輸入參數。

explain_relation

Explicar relação (MedGraphRAG, raciocínio multi-hop)

Raciocínio fundamentado sobre o grafo: dada uma pergunta (ex.: "por que o gene X se associa à doença Y?", "como a droga Z se relaciona a esta doença?"), retorna caminhos de evidência multi-hop (doença↔gene↔via↔droga↔fenótipo) com proveniência citável. Se não houver caminho no grafo, recusa — nunca inventa.

輸入參數query必填hpo_idsmax_hops

get_literature_relations

Relações mineradas da literatura (PubTator3)

Relações tipadas extraídas da literatura biomédica (associate/treat/cause/inhibit/stimulate/prevent) entre a doença e genes/fármacos, com nº de publicações como proveniência. Filtrável por predicado.

輸入參數orphaCode必填predicate

get_hypotheses

Hipóteses de reposicionamento (co-scientist)

Candidatos a reposicionamento de fármacos gerados por associação de genes (guilt-by-association): drogas que tratam outras doenças que compartilham genes com esta. HIPÓTESES para investigação, NUNCA recomendações clínicas — cada uma rastreável (via gene X, da doença Y).

輸入參數orphaCode必填

get_research_log

Diário de pesquisa do Disease Twin

Registro cronológico do que o agente autônomo fez por esta doença: autoria, mineração de literatura, evidência genética, verificação, prospecção de fontes, recomputação de relações. Prova de que o gêmeo digital estuda a doença continuamente.

輸入參數orphaCode必填

get_recent_updates

Disease Twins atualizados recentemente

Doenças cujo gêmeo digital ganhou evidência nova (autoria, PubTator3, Open Targets, verificação) nos últimos N dias. Faça polling para acompanhar mudanças (substituto stateless de subscriptions).

輸入參數dayslimit

get_evidence

Proveniência / evidências

Cross-references de autoridade (Orphanet, MONDO, OMIM, MeSH, GARD, UMLS), status de verificação e PMIDs de uma doença. A base da regra "nunca inventar".

輸入參數orphaCode必填

版本歷史

1
  1. v0.2.0最新Sep 16, 2026

評分

已滿足適用檢查項的 90%

該評分衡量此收錄條目的完整程度，依據註冊中心條目、端點與公開來源計算得出。它不是對伺服器本身的評價，也不表示伺服器安全或目前可用：可連通性是帶日期的檢查結果，評分也不包含安裝量或使用者評價。

  • 近 30 天內可連通必需25 分
  • 已宣告認證方式必需10 分
  • 已列出工具必需15 分
  • 描述必需15 分
  • 圖示10 分
  • 文件15 分
  • 授權條款10 分

    請在儲存庫或註冊中心條目中宣告授權條款。