Tooluniverse Protein Structure Retrieval
mims-harvard/tooluniverse/plugins/tooluniverse/skills/tooluniverse-protein-structure-retrieval作者 mims-harvard1c075878cea0无许可证1.7K 个星标收录于 2026年10月9日更新于 2026年10月9日仓库今天更新
Protein structure retrieval from RCSB PDB, PDBe, AlphaFold, SWISS-MODEL, 3D-Beacons (cross-provider structure aggregator), and PDB-REDO (re-refined X-ray structures), with disambiguation, quality assessment (resolution, R-factor, pLDDT, coverage), and metadata. Distinguishes high-quality experimental (X-ray under 2 Angstrom) vs predicted vs homology-model vs medium-quality structures. Use for fetching protein structures, structure-quality comparison, batch model-availability checks across a gene list, checking every structure provider at once, and selecting structures for drug design or modeling.
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